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최신 논문 소개

폐암에서 Hippo 패스웨이에 관여하는 유전자들과 NRG1에서 나타나는 반복적인 이상에 대해 전사체 메타분석
2015-01-26 09:17 written by ercsb (2024-10-12 19:09 Modify)
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Nat Commun. 2014 Dec.

Transcriptome meta-analysis of lung cancer reveals recurrent aberrations in NRG1 and Hippo pathway genes.

Dhanasekaran SM etc.

 

http://www.nature.com/ncomms/2014/141222/ncomms6893/full/ncomms6893.html

 

 미국 미시간 의과대학의 병리학센터에서 2014년 12월에 Nature communications에 폐암의 전사체 메타 분석에서 Hippo 패스웨이에 관여하는 유전자들과 NRG1에서 반복되는 aberration을 밝혀 냈다고 게재되었습니다.   
 폐암은 암 관련 사망의 주된 원인이고 조직학적으로 분류하면 비소세포폐암(NSCLC)과 소 세포 페암(SCLC)으로 분류됩니다. 비소세포폐암은 주요하위 유형인 선 암(lung adenocarcinoma, LUAD)과 편 평 상피세포 암(lung squamous cell carcinoma, LUSC)으로 작은 하위유형으로는 대 세포 암(lung large cell carcinoma, LCSC)과 선 양 낭성 암(lung adenoid cystic carcinomas, LACC) 으로 구분합니다. 선 암은 전 세계적으로 발생 빈도가 증가하고 있습니다.  선 암에 대한 게놈 분석을 통해 KRAS, EGFR, TP53, CDKN2A 및 STK11포함 하여 많은 종양 유전자와 종양 억제 유전자에서 돌연변이가 밝혀졌습니다.

 


 이 논문에서는 선 암종, 편평 세포 암종, 대 세포 폐암, 선양 낭성 암종 세포주 153 샘플의 전사체 분석을 수행하고 TCGA와 출판된 논문(The transcriptional landscape and mutational profile of lung adenocarcinoma)을 통합함으로써 753 폐암 샘플들에 대해 유전자들의 융합과 전사체학 측면에서의 이상에 대해 분석을 하였습니다. 매우 이질적인 폐암의 유전자 융합을 살펴보면 낮은 재발율과  개개의 융합들이 지배적임을 알 수 있습니다. 샘플에서 유전자의 융합되는 수는 낮은 생존율에 독립적인 예후 인자임을 보여주고 있습니다.  그리고 Hippo 패스웨이에 참여하는 핵심 유전자들에 영향을 미치는 유전자 융합(최근 보고된 CD74-NRG1, c-MET 엑손 스플라이싱 이벤트와  함께 NF1,NRG1)을 찾았습니다. 즉, 유전자 융합, 돌연변이, 발현데이터를 통합하여  이들의 이벤트를 통해 ~ 16 %를 차지하고 있는  핵심 돌연변이 없는 폐암 샘플들에 대해 총괄적으로 설명하고 있습니다. 

 

 
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Comments(5)

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